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宏基因组学病原体检测工具可以改变传染病的诊断方式

导读 犹他大学、ARUP 实验室和 IDbyDNA, Inc. 的科学家开发了名为 Taxonomer 的超快速元基因组分析软件,可显着提高病原体检测的准确性和...

犹他大学、ARUP 实验室和 IDbyDNA, Inc. 的科学家开发了名为 Taxonomer 的超快速元基因组分析软件,可显着提高病原体检测的准确性和速度。在今天发表在Genome Biology上的一篇论文中,合作者展示了 Taxonomer 分析临床样本中所有核酸(DNA 和 RNA)序列、检测病原体以及分析患者基因表达的能力。分钟。

传染病是世界上最大的杀手之一。全球每年有近 500 万 5 岁以下儿童死于传染病,但如果能够快速准确地识别病原体,许多感染是可以治疗的。

“在传染病领域,这种技术可能与人类基因组测序一样重要,”合著者、犹他大学 (U of U) 人类遗传学教授 Mark Yandell 博士说,HA 和 Edna Benning 总统捐赠主席、USTAR 基因发现中心联合主任、IDbyDNA 联合创始人。“很少有人患有遗传性遗传病。但在某些时候,每个人都会因感染而生病。”

当传染性病原体的遗传物质暴露时,它们就很难隐藏。在复杂的基因组分析和计算技术的推动下,分类学家开辟了一种全新的传染病诊断方法。对患者样本进行测序后,数据将通过互联网上传至 Taxonomer。在不到一分钟的时间内,该工具就会显示样本中所有病原体的缩略图清单,包括病毒、细菌和真菌。Taxonomer 的交互式实时用户界面由 IOBIO 系统提供支持,该系统由 USTAR 基因发现中心联席主任、犹他大学人类遗传学教授 Gabor Marth 实验室开发。

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